エンドトキシン（内毒素）は、グラム陰性菌が死んで溶菌する時に遊離される外膜の構成成分LPS（リポポリサッカライドまたはリポ多糖）のことを言う。
エンドトキシンは腸管によるセロトニンとNOの合成を促進し、自然免疫細胞であるマクロファージや樹状細胞の他にも様々な組織で発現がみられるTLR4受容体を活性化する。TLR4の活性化はセロトニン、NO、IL-1,6、NFkBカスケードを活性化し炎症を引き起こす。
PUFAは腸管バリアを損傷し、エンドトキシンの血液への流入を増やす。SFAはアルコールなどによる腸管バリア損傷を軽減し、エンドトキシンの流入を減らし、肝臓を保護する。また、SFAはTLR4活性化をブロックする。血中エンドトキシンレベルは全ての肝疾患の確かなバイオマーカーである。
エンドトキシンは肥満、糖尿病を引き起こす。マウスの実験で、無菌またはエンドトキシンフリーまたはPUFAフリーにすると、カロリーを増やしても肥らない。エンドトキシンによる慢性的な低グレードの炎症が肥満と糖尿病の原因となる。腸管の殺菌はインスリン抵抗性を改善する。
TLR4の活性化は精神病、神経変性症、糖尿病、がんなどの全て慢性疾患で認められ、エンドトキシンだけでなく、細胞デブリスもTLR4を活性化する。がんのカヘキシア（悪液質）はエンドトキシンによるTLR4による組織破壊により、慢性心不全、自己免疫疾患、老化のカヘキシアにも共通する。エストロゲンレベルが高いとエンドトキシンの変化に敏感になる。
エンドトキシンはアラキドン酸メディエーターなしで直接炎症を引き起こす。IL-1,6、TNFαなどサイトカインによる。ウイルス感染症におけるサイトカインストームにはエンドトキシンによるTLR4活性化が関与する。エンドトキシンとTLR4のブロックはウイルス感染症（COVID-19/ARDS）による死亡を防ぐ。エンドトキシンなしにHIV感染症はAIDSを発症しない。
腸内細菌は全ての自己免疫疾患の原因である。ループス患者の腸間膜リンパ節、肝臓にグラム陽性菌であるエンテロコッカス属が検出され、病原菌に対する抗体が産生され、自己免疫反応を引き起こす。抗菌薬が有効である。
TLR4アンタゴニスト：コレステロール、プレグネノロン、プロゲステロン、ナルトレキソン、アミトリプチン、シプロヘプタジン、オレンジジュース、ビタミンD/A、リボフラビン、エモジン、グリシン/ゼラチン、ミノマイシン。
腸管バリアの保護：Mg、ナイアシナミド、ビタミンA/E、テアニン、グリシン/ゼラチン、シプロヘプタジン、オンダンセトロン、PUFA/アルコールの回避、運動の回避。
注）参考文献を確認したい方は、Ray Peat Forum（https://raypeatforum.com/community/）でキーワード検索してください。（例えば、Haidut, PUFA, Diabetes）HaidutはGeorgi Dinkovのペンネームです。
